История начинается с Икаруги, юноши, оставшегося наедине с судьбой после трагической потери своих близких. В наследство от родных он получает лишь старый корабль и подводную лодку, которые становятся его единственным пристанищем в жестоком мире. Однажды он встречает девушку, также стремящуюся к наследию своей бабушки, и между ними завязывается неожиданная дружба.
Вместе они отправляются на поиски сокровищ, указанных на карте, но вместо богатства находят старинный гроб. Решив рискнуть, они открывают его и обнаруживают внутри андроида по имени Атри, чья память полностью стёрта. Это открытие становится началом их удивительного путешествия, где они стремятся помочь Атри восстановить свои воспоминания.
Таким образом, Икаруга, его новая подруга и Атри вступают в серию захватывающих приключений, которые не только меняют их жизни, но и раскрывают тайны прошлого, связывающие их судьбы в непредсказуемом и волшебном мире, полностью переворачивающем их представления о реальности.